Аниме сериал "Синие Мибуро" рассказывает о событиях, происходивших в Японии в 1863 году, на закате сёгуната, когда страна стояла на пороге больших перемен, утопая в крови. Главный герой - молодой сирота по имени Нио, который верен своим идеалам о справедливости. Однажды он встречает двух людей, Тосидзо Хидзикату и Окиту Содзи, которым суждено оказаться в центре будущей революции. Эти два человека были основателями группы бродячих самураев Мибуро, которые в будущем станут известными...